C言語のCGIは速いと思っていましたが実は遅かったんですね。Servletみたいにプログラムがメモリに常駐されていればディスクアクセスが発生するCGIに勝ち目は無いのか･･･でもFastCGI組み込んだらどうなんだろ？
以下の記事はCGIをC言語で作るというより、Apacheモジュールの作り方に重点を置いています。Webシステムのモジュールをバイナリ形式で配布する際にとても参考になりそうです。
ApacheModuleでWebアプリケーションをつくろう：CodeZine
http://codezine.jp/a/article/aid/2502.aspx